| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3231 | 杭州东 | 07:16 | 三门县 | 09:08 | 厦门北 | 14:14 | 漳州 | 14:35 |
| D3131 | 上海虹桥 | 07:32 | 三门县 | 10:39 | 厦门北 | 15:24 | 龙岩 | 16:37 |
| D3134 | 上海虹桥 | 07:32 | 三门县 | 10:39 | 厦门北 | 15:24 | 龙岩 | 16:37 |
| D3295 | 南京南 | 07:51 | 三门县 | 11:45 | 厦门北 | 16:40 | 龙岩 | 17:46 |
| D3298 | 南京南 | 07:51 | 三门县 | 11:45 | 厦门北 | 16:40 | 龙岩 | 17:46 |
| D3205 | 上海虹桥 | 09:35 | 三门县 | 12:38 | 厦门北 | 17:23 | 厦门北 | 17:23 |
| D3107 | 上海虹桥 | 09:39 | 三门县 | 13:05 | 厦门北 | 17:53 | 深圳北 | 21:09 |
| D3135 | 南京南 | 08:10 | 三门县 | 14:06 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D3138 | 南京南 | 08:10 | 三门县 | 14:06 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D2293 | 南京南 | 10:57 | 三门县 | 14:39 | 厦门北 | 19:18 | 深圳北 | 22:35 |
| D3215 | 宁波 | 14:12 | 三门县 | 14:59 | 厦门北 | 19:53 | 厦门北 | 19:53 |
| D3217 | 杭州东 | 16:05 | 三门县 | 17:53 | 厦门北 | 22:42 | 厦门北 | 22:42 |