| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D2289 | 南通 | 07:30 | 南通 | 07:30 | 上海虹桥 | 08:52 | 深圳北 | 20:23 |
| D2292 | 南通 | 07:30 | 南通 | 07:30 | 上海虹桥 | 08:52 | 深圳北 | 20:23 |
| D5461 | 启东 | 07:47 | 南通 | 08:35 | 上海 | 10:12 | 上海 | 10:12 |
| D5464 | 启东 | 07:47 | 南通 | 08:35 | 上海 | 10:12 | 上海 | 10:12 |
| D3125 | 淮安东 | 06:59 | 南通西 | 09:08 | 上海虹桥 | 10:25 | 深圳北 | 21:26 |
| D2283 | 南通 | 09:42 | 南通 | 09:42 | 上海虹桥 | 11:16 | 深圳北 | 22:24 |
| D2286 | 南通 | 09:42 | 南通 | 09:42 | 上海虹桥 | 11:16 | 深圳北 | 22:24 |
| D2135 | 烟台 | 07:34 | 南通西 | 13:46 | 上海虹桥 | 15:01 | 上海虹桥 | 15:01 |
| D2138 | 烟台 | 07:34 | 南通西 | 13:46 | 上海虹桥 | 15:01 | 上海虹桥 | 15:01 |
| D5591 | 阜阳西 | 09:31 | 南通西 | 14:02 | 上海 | 15:27 | 上海 | 15:27 |
| D5594 | 阜阳西 | 09:31 | 南通西 | 14:02 | 上海 | 15:27 | 上海 | 15:27 |
| D2123 | 济南西 | 08:37 | 南通西 | 14:36 | 上海虹桥 | 15:51 | 上海虹桥 | 15:51 |
| D5465 | 启东 | 14:47 | 南通 | 15:53 | 上海西 | 17:42 | 上海 | 17:58 |
| D5465 | 启东 | 14:47 | 南通 | 15:53 | 上海 | 17:58 | 上海 | 17:58 |
| D5468 | 启东 | 14:47 | 南通 | 15:53 | 上海西 | 17:42 | 上海 | 17:58 |
| D5468 | 启东 | 14:47 | 南通 | 15:53 | 上海 | 17:58 | 上海 | 17:58 |
| D9575 | 淮安东 | 15:55 | 南通西 | 17:31 | 上海 | 18:55 | 上海 | 18:55 |
| D5561 | 亳州南 | 14:16 | 南通西 | 19:14 | 上海虹桥 | 20:32 | 上海虹桥 | 20:32 |
| D5564 | 亳州南 | 14:16 | 南通西 | 19:14 | 上海虹桥 | 20:32 | 上海虹桥 | 20:32 |
| D3063 | 汉口 | 14:26 | 南通西 | 19:37 | 上海虹桥 | 21:01 | 上海虹桥 | 21:01 |
| D3066 | 汉口 | 14:26 | 南通西 | 19:37 | 上海虹桥 | 21:01 | 上海虹桥 | 21:01 |
| D3089 | 汉口 | 15:36 | 南通西 | 20:38 | 上海虹桥 | 21:59 | 上海虹桥 | 21:59 |
| D3092 | 汉口 | 15:36 | 南通西 | 20:38 | 上海虹桥 | 21:59 | 上海虹桥 | 21:59 |
| D2151 | 荣成 | 15:23 | 南通西 | 21:15 | 上海虹桥 | 22:32 | 上海虹桥 | 22:32 |
| D2154 | 荣成 | 15:23 | 南通西 | 21:15 | 上海虹桥 | 22:32 | 上海虹桥 | 22:32 |
| D4211 | 青岛北 | 16:47 | 南通西 | 21:21 | 上海虹桥 | 22:54 | 上海虹桥 | 22:54 |
| D2205 | 成都东 | 08:07 | 南通西 | 22:13 | 上海虹桥 | 23:16 | 上海虹桥 | 23:16 |
| D2208 | 成都东 | 08:07 | 南通西 | 22:13 | 上海虹桥 | 23:16 | 上海虹桥 | 23:16 |