| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3238 | 南京南 | 06:13 | 南京南 | 06:13 | 厦门北 | 16:39 | 厦门北 | 16:39 |
| D2281 | 南京南 | 06:32 | 南京南 | 06:32 | 厦门北 | 16:54 | 深圳北 | 20:17 |
| D3295 | 南京南 | 07:51 | 南京南 | 07:51 | 厦门北 | 16:40 | 龙岩 | 17:46 |
| D3298 | 南京南 | 07:51 | 南京南 | 07:51 | 厦门北 | 16:40 | 龙岩 | 17:46 |
| D3135 | 南京南 | 08:10 | 南京南 | 08:10 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D3138 | 南京南 | 08:10 | 南京南 | 08:10 | 厦门北 | 19:09 | 赣州 | 22:40 |
| D2293 | 南京南 | 10:57 | 南京南 | 10:57 | 厦门北 | 19:18 | 深圳北 | 22:35 |
| D3141 | 南京 | 11:17 | 南京 | 11:17 | 厦门北 | 20:59 | 龙岩 | 22:02 |